À la fois un producteur de studio d'enregistrement et un groupe dans sa configuration en public, Molecule se fait connaître par la scène avant de publier en 2006 son premier album Part of You. L'album hésite visiblement entre reggae français et electro-dub, les parties chantées y étant nombreuses.
En 2007, la suite In Dub V 1.0 clarifie les choses en se rapprochant d'un son dub plus caractéristique. Deux ans plus tard sort Climax, produit entre deux tournées, avec des invités comme Arielle Dombasle et Charlélie Couture. L'un de ses titres, « Faluja », sert de base aux remixes publiés l'année suivante. La même année 2010 voit la sortie de l'album Besides, avec la participation de la chanteuse de Massive Attack et de Tricky, Martina Topley-Bird. En 2012 suit l'EP Orages et trois ans plus tard, l'album 60° 43° Nord.