Anne Etchegoyen est née en 1980 à Saint-Palais (Pyrénées-Atlantiques) à l'intérieur du Pays basque français. Elle commence à chanter dans la chorale de son village dès l'âge de huit ans. Elle débute ensuite les concours de chant tout en poursuivant des études de chant lyrique aux conservatoires de Bayonne et de Bordeaux. Anne Etchegoyen débute sa carrière professionnelle en 2000 avec la comédie musicale régionale Euskal Spiritü. Elle poursuit avec une tournée en compagnie du célèbre choeur d'hommes Oldarra.
Conviée en 2003 à l'Elysée pour la traditionnelle réception du 14 juillet, elle y incarne la vivacité de la tradition basque. Un mois plus tard, Anne Etchegoyen se produit au Stade de France à Saint-Denis (Seine-Saint-Denis) où elle interprète « La Marseillaise » en ouverture des Championnats du Monde d'Athlétisme. Quelques mois avant était sorti son premier album Anne Etchegoyen qui avait attiré l'attention des médias sur sa capacité à réinventer le chant basque. Surtout connu en dehors pour ses choeurs d'hommes, le chant basque est en fait issu d'une tradition orale mixte qui remonte au Moyen Âge. Invitée d'émission populaires comme Vivement Dimanche sur France 2, Anne Etchegoyen prend bientôt une carrure d'artiste nationale.
Elle poursuit son chemin avec les albums Otentik (2005) et Pachamama (2008), parus sur le label basque Agorilla. En 2010 est réédité Pachamama, augmenté d'extraits du passage d'Anne Etchegoyen à l'Olympia de Paris l'année précédente. C'est avec le choeur d'hommes Aizkoa qu'elle sort en 2013 l'album Les Voix Basques. Moins personnel que ses précédents enregistrements, Les Voix Basques bénéficie d'une intense campagne promotionnelle qui en fait l'un des grands succès de l'été 2013 grâce au soutien de la maison de disques Sony Music.
Anne Etchegoyen et le choeur Aizkoa poursuivent leur adaptation du répertoire basque avec Les Voix Basques : Berriz, paru en juin 2014. Cette fois, en plus des thèmes traditionnels, des reprises issues de la chanson française et espagnole sont au programme. En 2017, l'album Compostelle : du Pays Basque à Saint-Jacques se classe à sa sortie parmi les cent meilleures ventes hexagonales.
