1996 yılı İstanbul Teknik Üniversitesi Türk Musikisi Devlet Konservatuarı mezunu olan ve eğitiminin ardından iki yıl boyunca müzik öğretmenliği ve sahne çalışması yapan Funda Arar, ilk albümü Sevgilerde'yi 11 Şubat 2000 tarihinde çıkardı. Sevgilerde albümünde Necip Fazıl Kısakürek'in şiiri Kaldırımlar'ı seslendirmiştir. Albümde Kaldırımlar'ın yanı sıra Behçet Necatigil'in Sevgilerde, Gülsüm Cengiz'in Yağmur, Şeyda Kılınç'ın Ay Doğmadan Gel şiirleri de yer almaktadır.
Sanatçı 2001 yılının Şubat ayında ise Kıraç ile birlikte yaptığı düet albümünü çıkardı. Albümde yer alan Sevgiliye adlı şarkı Arar'ın ilk klip çalışması olmuştur. Sevgiliye albümünde yer alan bazı şarkıları ise Funda Arar'ın bestelediği şarkılardır. Albümde yer alan ve söz ile müziği Funda Arar'a ait Seni Düşünürüm şarkısına klip çekilmiştir. Sanatçı 2002 yılında Magazin Gazetecileri Derneği'nden Kıraç ile birlikte yaptığı Sevgiliye albümü ile en iyi çıkış yapan sanatçı ödülünü kazanmıştır.
2002 senesinin Mart ayında Alagül lbümünü çıkaran sanatçı bu albümde Erkin Koray'ın seslendirdiği "Arapsaçı" şarkısına yer vermiştir. 2003 yılının Ekim ayında üçüncü solo albümü Sevda Yanığı'nı çıkaran sanatçı albüm ile aynı ismi taşıyan Sevda Yanığı adlı parçaya klip çekmiştir. Albümünde Ahmed Arif'e ait "Haberin Var mı" adlı parçayı tekrar yorumlayan Arar, Sevda Yanığı albümü ile 31. Hürriyet Gazetesi Altın Kelebek Yarışmasında En İyi Çıkış Yapan Sanatçı ödülünü kazanmıştır. Arar, 2,5 yıl aradan sonra 3 Mart 2006 tarihinde "Son Dans" adlı albümünü çıkartmış ve albümün ilk parçası olan Karartma Günleri çıkış klibi olmuştur. Sanatçı, geçmişte Bergen'in seslendirdiği Benim İçin Üzülme adlı şarkıyı yeniden yorumlayarak albümde yer vermiştir.
2006 - 2007 yıllarında Arar, sanatçı Kıraç ile yaptığı Gölgeler programında şarkılar seslendirmiştir. Ayrıca 2007 senesinde toplam satış rakamlarına göre düzenlenen MÜ-YAP Müzik Ödülleri kapsamında "Son Dans" albümü ile "Platin Ödül" kazanmıştır. 2008 yılında Rüya adlı bir Türk Sanat Müziği albümünü çıkaran Arar, 2,5 yıl aranın ardından Zamanın Eli adlı albümünü 6 Mart 2009 tarihinde çıkarmıştır.
Sanatçı, 2009 yılında çıkardığı "Zamanın Eli" albümünün ardından, “Aşkın Masum Çocukları”adlı son albümünü 10 Şubat 2011 tarihinde yayınlamıştır. Arar bu albümünde de Nazım Hikmet'in bir şiirini yorumlamıştır. Albümde yer alan "Sevdiklerim" adlı şarkının söz ve müziği de sanatçıya aittir.