En 1999, le groupe amené à s'appeler Seether se forme avec le chanteur et guitariste Shaun Morgan (né Welgemoed), acompagné de Dale Stewart (basse) et David Cohoé (batterie). Sous le nom de Saron Gas, le groupe sud-africain de rock alternatif tendance metal sort avec succès son premier album Fragile (2000) sur le label Musketeer. La notoriété du groupe dépasse les frontières et le label Wind Up se charge de distribuer le disque sur les marchés australien et américain.
Rebaptisé Seether, le quatuor publie un nouvel EP et participe au Ozzfest Festival. En 2002, l'album Disclaimer reprend certains titres du disque précédent remixés et offre le single « Fine Again ». Le guitariste Pat Callahan est arrivé en renfort mais David Cohoé est remplacé par Nick Oshiro au poste de batteur. Quelques mois plus tard, il laisse sa place à John Humphrey pour l'album Disclaimer II (2004), ré-enregistrement du précédent.
Seether se fait davantage connaître grâce au duo « Broken » chanté avec Amy Lee, du groupe Evanescence, qui n'est autre que la compagne de Shaun Morgan. Le single trouve sa place sur la bande originale du film The Punisher. En mai 2005, le troisième album de Seether, Karma and Effect, est poussé par le single « Remedy ». En 2006 sort le CD/DVD live One Cold Night, alors que Pat Callahan cède sa place à Troy McLawhorn.
Séparé d'Amy Lee et sorti d'une cure de désintoxication, Shaun Morgan reprend le chemin des studios pour offrir aux nombreux fans l'album Finding Beauty In Negative Spaces (2007), accompagné du single « Fake It ». En 2011 suit Holding Onto Strings Better Left to Fray, produit par Brendan O'Brien, qui se classe n°2 aux États-Unis. Cela reste la meilleure performance du groupe qui voit partir son guitariste Troy McLawhorn.
Évoluant désormais en trio, Seether fait à nouveau appel à Brendan O'Brian pour l'album suivant Isolate and Medicate (2014), classé n°4 aux États-Unis.Trois ans après paraît le septième album Poison the Parish (2017), produit par Shaun Morgan et assorti du single « Let You Down ». Le guitariste Clint Lowery appuie le groupe lors de la nouvelle tournée.