Third Eye Blind voit le jour à San Francisco en 1993. Le guitariste et chanteur Stephan Jenkins (né en 1964) est à la tête de ce groupe de rock alternatif influencé par le grunge. Il recrute le guitariste Tony Fredianelli et le bassiste Arion Salazar (ex-Fungo Mungo) quand celui-ci est disponible. Kevin Cadogan partage le poste de guitariste à la fin de l'année 1995 et introduit le batteur Brad Hargreaves (ex-Counting Crows).
Le groupe attire rapidement l'attention des labels sur la foi de musiciens expérimentés, d'une base de fidèles de leurs concerts (dont une première partie d'Oasis) et d'une démo de 14 titres qui contient les hits de leur premier album. Sorti au printemps 1997, Third Eye Blind fait un carton dans les charts américains et draine les singles « Semi-Charmed Life » (n° 4 du Top 100 et single Modern Rock de l'année du Billboard), « Jumper » (n° 5) et « How's It's Going to Be » (n° 9).
En comparaison, l'album suivant Blue (novembre 1999) fait pâle figure malgré les scores honorables des singles « Anything » et « Never Let You Go » (n° 14). Il ouvre surtout une faille dans le groupe qui se sépare de Kevin Cadogan, guitariste et principal co-compositeur, durant la tournée mondiale subséquente. Ces événements conduisent Third Eye Blind dans une période difficile marquée par l'album Out of the Vein (mai 2003), échec majeur du groupe malgré le hit potentiel « Blinded ».
Il s'ensuit un long silence où le doute ronge le meneur Stephan Jenkins. La compilation A Collection le rappelle à ses bons souvenirs en 2006. Ces affres d'écriture semblent oubliées lorsque paraît l'EP digital Red Star en novembre 2008. Le groupe revient gonflé à bloc avec le quatrième album Ursa Major, classé numéro un des ventes de rock indépendant en août 2009 et numéro trois du Billboard, qui pourvoit un nouveau hit avec « Don't Believe a Word ».
Après la tournée qui suit, Tony Fredanielli fait ses adieux, conduisant le groupe à une nouvelle pause, le temps de recruter le guitariste irlandais Kryz Reid. C'est une formation complètement remaniée, avec le bassiste Alex LeCavalier et le joueur de claviers Alex Kopp, qui enregistre le cinquième album Dopamine (juin 2015, n° 13), muni du simple « Everything Is Easy », dont la face B comprend la reprise d'un titre de Beyoncé, « Mine ».
Le groupe, engagé politiquement, sème la controverse lors d'une prestation de charité en mars 2016 au Rock and Roll Hall of Fame à Cleveland, s'en prenant au Parti républicain dont la convention annuelle se tient alentour. En octobre paraît l'EP We Are Drugs, comprenant le titre « Cop vs. Phone Girl ». Third Eye Blind retourne en studio pour réaliser le mini-album Thanks for Everything, paru en août 2018. Celui-ci, dont les bénéfices vont à la Fondation Andy Warhol, est constitué de sept reprises d'après Bon Iver, Tim Buckley, Queens of the Stone Age, Babyshambles, Santigold, Chastity Belt ou Happy Driving.
